A Faculdade de Veterinária da UFF conta atualmente com dois programas stricto sensu de pós-graduação: um na área de Clínica e Reprodução Animal e outro na área de Higiene Veterinária e Processamento Tecnológico de Produtos de Origem Animal.
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CLÍNICA E REPRODUÇÃO ANIMAL
Tem como proposta desenvolver projetos na linha de pesquisa de Clínica Diagnóstica, Preventiva e Terapêutica em Medicina Veterinária e na linha de pesquisa de Fisiopatologia e Biotécnicas da Reprodução.
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM HIGIENE VETERINÁRIA E PROCESSAMENTO TECNOLÓGICO DE PRODUTOS DE ORIGEM ANIMAL
Tem como objetivo principal a preparação de docentes e pesquisadores que possam vir atuar em diferentes Instituições de Ensino e Pesquisa, bem como no Serviço de Inspeção Federal do Ministério da Agricultura e das Secretarias Estaduais e Municipais de Agricultura e Saúde que atuam em indústrias e vigilância sanitária. Outro objetivo do referido Programa é a formação de responsáveis técnicos, consultores e técnicos em controle de qualidade que possam vir a aluar em indústrias de produtos de origem animal, visando, sempre, a melhoria tecnológica e sanitária dos alimentos.